微生物是一切肉眼看不见或看不清的微小生物，个体微小，结构简单。通常指要用光学显微镜和电子显微镜才能看清楚的生物。微生物包括原核类、真核类和非细胞类。根据存在的不同环境分为原核微生物、空间微生物、真菌微生物、酵母微生物、海洋微生物等。
