对一级菌种培养基进行灭菌的方法是采用高压灭菌进行灭菌。一般培养基可用121℃保持20min即可达到灭菌效果，已经把菌丝营养体、孢子、芽孢全部杀死。但如果基质内含有葡萄糖、马铃薯、豆芽汁、维生素等物质则应用115℃保持20min为宜，否则过高温度会破坏营养物。
