因为棉纤维结晶区的孔径仅为lnm，因此对直径为几纳米到几十纳米的纤维素酶来说，进入这样紧密的结构是很困难的。所以纤维素酶是无法分解棉织物的。纤维素酶，是由多种水解酶组成的一个复杂酶系，自然界中很多真菌都能分泌纤维素酶。习惯上，将纤维素酶分成三类：C1酶、Cx酶和β葡糖苷酶。C1酶是对纤维素最初起作用的酶，破坏纤维素链的结晶结构。