1、光能自养型。属于这一类的微生物都含有光合色素，能以光作为能源，二氧化碳作为碳源。如蓝细菌含叶绿素、红硫细菌和绿硫细菌等少数微生物含细菌叶绿素能利用光能从二氧化碳合成细胞所需的有机物质。但这种细菌在进行光合作用时，除了需要光能外还需有硫化氢的存在，它们从硫化氢中获得氢，而高等植物则是在水的光解中获得氢以还原二氧化碳。2、光能异养型。以二氧化碳为主要碳源或唯一碳源，以有机物如异丙醇作为供氢体，利用光能将二氧化碳还原成细胞物质，红螺菌属中的一些细菌属于此种营养类型。3、化能自养型。以二氧化碳或碳酸盐作为唯一或主要碳源，以无机物氧化释放的化学能为能源，利用电子供体如氢气、硫化氢、二价铁离子或亚硝酸盐等使二氧化碳还原成细胞物质。4、化能异养型。