第一、预防癌症，癌症也是因自由基毁坏遗传物质而导致的。借着保护遗传物质，能间接的保护我们对抗癌症。虽然是长期的，但是花青素确有间接的保护作用。而花青素清除自由基的功效，亦可让癌细胞无法顺利扩散，借此保护更多健康的细胞免于被癌细胞侵蚀。另一方面有些癌症透过溶解组织和细胞的物质形成肿瘤，这些癌细胞产生溶解脢和蛋白脢，而花青素能保护蛋白质不受蛋白脢的影响。像是乳腺癌的致病机制便是如此，因此服用花青素对于乳腺癌的发展会有很好的抑制作用。