1、有丝分裂；干细胞能通过有丝分裂产生子代干细胞。干细胞的分裂过程与普通的体细胞有所不同。高等动物的成体干细胞通过不对称分裂产生非对称的细胞决定子分割，使得一部分子代获得维持干细胞状态所必需的信息而成为子代干细胞，另外一部分子代细胞则不得不走向分化。也就是说，一个干细胞的后代中，只有一部分子代细胞可能保持与父代细胞相同的干细胞特征，另外一部分则丧失了干细胞的功能。2、不对称分裂；干细胞的不对称分裂主要有两种方式。一种方式是细胞严格遵循不对称分裂的方式，如果蝇的卵细胞，一个干细胞分裂后，产生一个子代干细胞和一个已分化细胞。这种分裂方式主要发生在低级动物。如单一细胞生物体及无脊椎动物。