光纤纵差保护是实际上就是一种差动保护。只不过将两侧的电气量先转换成数字信号后，再通过光纤进行双侧通讯，对两侧的电气量进行比较。而一般的差动保护主要比较两侧的电流差，用的是控制电缆形成差流回路，为防止CT二次回路负载太大，差流回路的电缆不可能很长。但光纤差动不存在这个局限性。光纤差动保护目前一般应用在很重要的线路中作为主保护，并且可以保护线路的全长。