一般办理注销新农合，需要本人亲自办理，并携带本人的身份证原件，和本人的医保卡（社保卡），前往行政办公大厅，找到医保局的新农合服务窗口，进行办理。
具体的办理材料和流程，也要根据当地的具体规定进行办理。可向所在村及乡镇政府的“合作医疗管理办公室”咨询后，再前往相关窗口办理。
新农合的基金收缴、参合、停保、注销，等具体工作，是由国家卫生计生委统一部署，各地进行具体安排的。通常由所在村负责收缴费用，由乡镇合管办进行办理，最后汇集到医保局进行电脑的实缴操作。
法律依据：
《中共中央、国务院关于进一步加强农村卫生工作的决定》规定，农村合作医疗制度应与当地经济社会发展水平、农民经济承受能力和医疗费用需要相适应，坚持自愿原则，反对强迫命令，实行农民个人缴费、集体扶持和政府资助相结合的筹资机制。农民为参加合作医疗、抵御疾病风险而履行缴费义务不能视为增加农民负担。有条件的地方要为参加合作医疗的农民每年进行一次常规性体检。
