分辨珍珠龟公母主要是看外表。先从外部轮廓看，雄龟是比较窄而长的，而雌龟是又宽又圆的。其次看它们的腹甲部分，雌龟更加平坦一些。再次看它们的尾巴，雌龟的尾巴更细长，雌龟尾巴是粗短的。最后看泄殖孔，雄龟的泄殖孔离腹甲边缘要远一点，形状是长形的，而雌龟的近似于圆形。
珍珠龟主要通过外表来进行公母分辨。从体型上来看，雄龟的背甲长并且窄，而雌龟的背甲比较圆比较宽。而从腹甲部分来看，由于生理活动的需要，雄龟腹部一般会有凹陷，而雌龟的腹部看上去则十分平坦。从尾巴处观察，雄龟的尾巴比较短，根部粗壮，而雌龟的尾巴看上去就比较细长。最后，两者的泄殖孔也是有区别的，雄龟的泄殖孔离腹部的后面的边缘处比较远，形状是长方形的，而雌龟则距离腹甲的边缘处比较近，形状近似于圆形。
珍珠龟公母是可以同居的。珍珠龟总体来看性格比较温和，一般不会去进行主动攻击。并且如果条件成熟的话，可能会产生自然繁殖的现象。只是在混养的过程中，注意养殖的密度，如果密度比较大的话，尽量需要隔离一下，因为难免会产生领地意识，一些个头比较大的就容易去欺负个头比较小的。因此公母是可以同居的，只是需要注意密度问题。
