1、元朝政治制度承袭宋朝制度，采取文武分权的制度，以中书省总理政务，枢密院掌管兵权。
2、元朝的中书省已成为中央最高行政机关，元朝不设置门下省，尚书省时设时不设，元世祖时期与元武宗时期有设置，所以门下省与尚书省的权力皆交给中书省。
3、中书省统领六部，主持全国政务，形成明清内阁制的先驱。其组织架构继承南宋体制。副相方面有左右丞、参政等。六部共有吏部、户部、礼部、兵部、刑部与工部，内有尚书侍郎。
4、尚书省主要负责财政事务，时置时废。枢密院执掌军事，御史台负责督察，与宋朝制度大致相同，在地方设有行中书省、行枢密院与行御史台。
5、掌管学校的集贤院、掌管御膳的宣徽院、掌管驿传的通政院，其他还有太常礼仪院、太史院、太医院与将作院，略前代的九寺诸监。最后新成立的是宣政院，负责佛教及吐蕃地区军政事务。
