1、种球繁殖。采用次生小种球进行繁殖。该法见效快，病害少。百合的地上茎地表部分会长出1厘米至2厘米大小的种球次生小鳞茎，采收百合时留下，埋在沙里，秋播时作种用。
2、珠芽繁殖。麝香百合不产生珠芽，其他百合夏天在其叶腋处能长出蚕豆粒大小的珠芽即气生小鳞茎，每株可产生40粒以上。夏季气温不断升高，珠芽会脱落，应在脱落前采收，留作种用，当年9月至10月播种。
3、鳞片繁殖。待鳞茎充分成熟后掘起，选肥大无病虫害的，用利刀把鳞片从基部切下，随即播于铺沙壤土的苗床中。
