呼伦贝尔下辖13县级行政区即旗(包括自治旗)、县级市和市辖区,具体如下:
1、7个旗,即4个旗和3个自治旗:阿荣旗、新巴尔虎左旗、新巴尔虎右旗和陈巴尔虎旗;莫力达瓦达斡尔族自治旗、鄂伦春自治旗和鄂温克族自治旗。
2、5个县级市:满洲里、扎兰屯、牙克石、根河和额尔古纳市。
3、市辖区:海拉尔区(以前为县级“海拉尔市”)。