水稻铁锈病可以改良土壤，加深耕作层，增施有机肥，提高土壤肥力，改善土壤团粒结构。改造低洼浸水田，做好排水沟。绿肥做基肥，不宜过量，耕翻不能过迟。施用有机肥一定要腐熟，均匀施用。
宜早施钾肥，如氯化钾、硫酸钾、草木灰、钾钙肥等。缺磷土壤，应早施、集中施过磷酸钙每667m2施30kg或喷施0.3%磷酸二氢钾水溶液。忌追肥单施氮肥，否则加重发病。早稻要浅灌勤灌，及时耘田，增加土壤通透性。发病稻田要立即排水，酌施石灰，轻度搁田，促进浮泥沉实，以利新根早发。于水稻孕穗期至灌浆期叶面喷施多功能高效液肥万家宝500-600倍液，隔15天1次。
