毛蚶的壳及内部黑色内脏都是不能食用的，毛蚶的壳是硬的，和其他贝类食物一样，都是不能吃的。另外，毛蚶是长在淤泥里的，壳内的黑色内脏会残留很多细菌或病毒，还有消化残留物，所以也是不能吃的。
毛蚶一定要煮透后再吃，很多人都是喜欢直接将毛蚶在水里面烫一下就吃或者是直接就生吃了，这样是不能够很好的杀灭其内的细菌病毒的，食用不安全。因此建议大家吃毛蚶时，应尽可能是在100度的沸水里面煮5到10分钟后再食用，这样是会更加安全一些，而且口味也是不会一样的。
