深圳海关在不同的口岸，开关时间不同。
罗湖海关通关营业时间：早上6点到晚上24点；文锦渡口岸：早上7点到晚上22点；皇岗口岸（货车）：24小时全天通关；福田口岸（旅客过境专用口岸）：早上6点30分到晚上24点；沙头角口岸：早上7点到晚上20点；(蛇口)港澳客运码头：24小时全天通关；深圳湾口岸：早上6点30分到晚上24点。
