《w两个世界》讲述的是现实世界中的女医生吴妍珠意外进入到了父亲所绘制的人气漫画《w》的世界中，在漫画世界与漫画主人公姜哲相遇后所发生的一系列故事。
剧中，女主吴妍珠是一个女医生，她的父亲吴成务是人气漫画《w》的作者。在《w》这本漫画连载还剩下最后一回时，吴成务突然消失不见。
吴妍珠在寻找父亲的过程中发现了父亲作画用的数位板，数位板将吴妍珠拉进了漫画世界。在漫画世界中，吴妍珠遇到了奄奄一息的姜哲，她作为医生，救死扶伤是责任，所以她将姜哲成功的从鬼门关拉回。
姜哲被救以后，吴妍珠却消失了，对于这个救了自己一命却又消失的女人，姜哲十分好奇，但是在他所在的世界，并没有吴妍珠的痕迹。因此，姜哲认为吴妍珠和自己多次遇害肯定有关系。
吴妍珠在进入漫画世界后得知，自己已经改变了漫画世界的格局，虽然她不知道下一次进入漫画世界是什么时候，可是她明白，父亲所创作的《w》已经不受他的控制了。
吴妍珠多次被吸进漫画世界，又莫名其妙的回归到现实世界，她和姜哲之间也莫名有了牵扯。在和姜哲相处的过程中哦，吴妍珠渐渐喜欢上了这个男子。
其实，当时姜哲的形象就是按照吴妍珠的理想型创作的，吴成务非常疼爱自己的女儿，所以就把漫画主人公设定成女儿喜欢的类型，并且把漫画女主人公用成女儿的名字。
虽然在剧中，吴妍珠和姜哲在一起了，可是吴妍珠的父亲却和漫画中的黑衣人同归于尽了。
