区别是：百分百控股可能是间接控制目标公司经营控制权，收购是可以直接控制目标公司经营控制权。
举例：如乙公司有甲公司和丙公司两个股东，甲公司拥有乙公司30%的股权，丙公司拥有乙公司70%的股权，表面上看是丙公司是乙公司的控股股东，但是甲公司拥有丙公司100%的股权，则甲公司实际上拥有乙公司百分百的股权，对乙公司形成实际上的间接控股。
收购则是一般情况下目标有限责任公司会全部交出经营控制权或持有一家上市公司发行在外的股份的30%时发出要约收购该公司股票的行为，其实质是购买被收购企业的股权。
