只要符合自愿合法原则，分居协议有效。
【法律依据】
根据《最高人民法院，关于人民法院审理离婚案件，如何认定夫妻感情确已破裂的若干具体意见》第七条，因感情不和分居已满3年，确无和好可能的，或者经人民法院判决不准离婚后又分居满1年，互不履行夫妻义务的。
