埃及全国干燥少雨,气候干热。埃及南部属热带沙漠气候,夏季气温较高,昼夜温差较大。尼罗河三角洲和北部沿海地区,属亚热带地中海气候,气候相对温和,其余大部地区属热带沙漠气候。白尼罗河发源于南半球的热带草原气候区,青尼罗河发源于北半球的热带草原气候区,两河汛期不同。
1月平均气温12摄氏度,7月26摄氏度;全境干燥少雨,年均降水量50毫米到200毫米。余大部地区属热带沙漠气候,炎热干燥,气温可达40摄氏度 。每年4月到5月间常有“五旬风”,夹带沙石,损坏农作物。