碳水化合物，天然水体中的碳水化合物包括各种单糖和复杂的多糖类；腐殖质，在天然水域和土壤中，尤其是泥碳和腐泥中，广泛存在着分子组成复杂、性质较为稳定、而化学成分不十分确定的一类有机化合物，通常称为腐殖质；类脂化合物，类脂化合物是能被非极性或弱极性有机溶剂萃取的组分；含氮有机物，水体中含氮有机物主要是氨基酸和多肽，氨基酸是蛋白质的基本组成单元，其主要来源于浮游生物的代谢和分解产物，它能为异养微生物提供有机物质和能源；烃类烃类，能与类脂物同时被有机溶剂萃取，在环境污染的监测中，水体中烃类有其特殊的重要性；维生素，在天然水体中已检出的维生素有硫胺素、钴胺素和生物素，它们在水体中的含量极微，但与生物生长关系十分密切；其它化合物，除了上述几种主要化合物外，在水体中已检出的还有丙酮、丁酮、甲乙酮、丁醛、糠醛、核酸、甲烷、乙烷、丙烷、乙酸乙酯和某些刺激素和生长抑制剂等有机化合物。
