咪唑上去掉一个和氮原子直接相连的氢原子后剩下的部分就叫咪唑基。组氨酸中含有咪唑基，其在生理条件下具有缓冲作用。组氨酸中的咪唑基能够发生多种化学反应，可以与ATP发生磷酰化反应，形成磷酸组氨酸，从而使酶活化。组氨酸的咪唑基也可发生烷基化反应，并引起酶的活性降低或丧失。组氨酸中的咪唑基能与重氮盐，如重氮苯磺酸发生Pauly反应生成棕红色物质。
