苹果用种子繁殖。
苹果的正常果实，每果有5个心室，每心室有种子2粒。在果实发育过程中，种子分泌激素刺激果肉生长，所以授粉受精良好、种子充实饱满的，果形端正，果肉丰腴；反之，种子发育不良或无种子的一方，果肉凹陷瘦削而成畸形果，因此一定要配置授粉树和改善授粉。
苹果的果实是由子房和花托发育而成的假果，其中子房发育成果心，花托发育成果肉，胚发育成种子。果实的体积膨大，前期靠细胞迅速分裂的细胞数目的增多，后期靠细胞体积的膨大。
