本菌为致病菌能引起人、畜和禽类的肺曲霉病及其他疾病。侵染棉铃和苹果等，引起果实腐烂，或寄藏于种子上。烟曲霉存在于谷物、污染的食品、土壤和霉腐物中 ，是引起人和动物曲霉病的重要病原菌。感染肺部 和其他器官，也能引起敏症。现一般为人工保存。
