外观不同:蜈蚣呈扁平长条形,全体由22个环节组成,最后一节略细小。头部两节暗红色,有触角及毒钩各1对;背部棕绿色或墨绿色,有光泽,并有纵棱2条。百足虫体形呈圆筒形或长扁形,分成头和躯干两部分,头上长有一对粗短的触角;躯干由许多体节构成,多的可达几百节。
特征不同:蜈蚣气微腥,并有特殊刺鼻的臭气,味辛而微咸。脚呈钩状,锐利,钩端有毒腺口,一般称为腭牙、牙爪或毒肢等,能排出毒汁。被蜈蚣咬伤后,其毒腺分泌出大量毒液,顺腭牙的毒腺口注入被咬者皮下而致中毒,毒素不强,被蛰后会造成疼痛但不会致命。百脚虫气味辛、温,有毒,有些无毒。
功效不同:蜈蚣可息风镇痉、攻毒散结、通络止痛、半身不遂、破伤风症、风湿顽痹等。百脚虫可破积解毒、腹中症积、化瘜肉、扁桃体炎等。