木瓜：大体上分为药用木瓜皱皮木瓜和食用木瓜。药用木瓜主要是皱皮木瓜，皱皮木瓜属于蔷薇科木瓜属，植株为小乔木或者灌木，树高在3到10米不等，所结的果实主要是药用，表皮粗糙。食用木瓜主要是青木瓜或番木瓜，青木瓜属于番木瓜属，植株为常绿小乔木，表皮光滑，果实略苦涩，糖分低，果浆味浓，主要是当作水果食用，也可作为蔬菜食用。
哈密瓜：属于甜瓜属、葫芦科，果实呈椭圆形或圆形，肉质脆硬且糖分高，气味香浓、口感脆甜。哈密瓜种类比较多，按表皮分为网纹皮哈密瓜和光皮哈密瓜；按成熟期分为早熟瓜、夏瓜和冬瓜，果肉有橙色、白色和绿色等多个品种，营养价值都比较高。
它们的主要区别：
1、木瓜大多指的是青木瓜，是一种具有美白护肤、促消化等功效的水果，但木瓜性寒，不宜多吃。
2、哈密瓜富含多种营养物质，具有非常好的美容保健功效，但哈密瓜含糖量太高，因此高血糖、糖尿病患者不宜食用。
3、木瓜籽是圆的黑的，而哈密瓜籽是扁扁的；木瓜果肉呈暗黄色，哈蜜瓜果肉呈白色；木瓜的外皮比哈密瓜更柔软。
