初步清理时，先用温水浸泡金刚菩提半小时，待果肉软化后用钢丝刷刷，刷完之后用手纸包起来阴干。进行过深度清理的金刚菩提，不需要用水泡，直接用钢丝刷慢慢刷就行了。
金刚菩提的清洗方法只是初步清理的金刚菩提，建议先下水，先用温水浸泡至少半小时，待果肉软化后，沿着纹路用钢丝刷慢慢地刷。
遇到刷子刷不到的缝隙，可以用刷子轻轻敲打金刚菩提。刷完之后，将金刚菩提用手纸包起来，放进抽屉阴干一天一夜。
如果金刚菩提已经进行过深度清理，只是缝隙处有少量的果肉残渣，这种情况下可以直接用钢丝刷来刷，跳过下水浸泡的步骤。
