1、水晶多部分是纯色系，碧玺是多色系。
2、碧玺的比重要比水晶大，可以从手感去判断重量，肉眼观察光泽度。
3、两者的化学成分不同，碧玺是一种复杂的硅酸盐，水晶是一种无色透明的大型石英结晶体矿物。水晶的主要化学成份是二氧化硅，当二氧化硅结晶完美时就是水晶，二氧化硅胶化脱水后就是玛瑙，二氧化硅含水的胶体凝固后就成为蛋白石，二氧化硅晶粒小于几微米时，就组成玉髓、燧石、次生石英岩。
