酵素肥的好处有：
1、培肥地力，活化土壤，施用酵素生物有机肥后，增加土壤的有机质和氮、磷、钾等养分；
2、促进生长，增产增收，酵素菌肥施入土壤后，有益微生物在土中迅速繁殖，会产生多种对作物有益的代谢产物这些代谢产物可刺激或调控作物生长，使作物健壮，达到增产目的；
3、抑制病害，增强抗性，酵素菌肥施入土壤后，在植物根系周围形成优势菌群，排挤和抑制土壤中的有害菌，还能释放抗生素类物质，有利于消灭或抑制病原微生物；
4、 提高品质，改善口感，施用酵素菌肥改善作物的营养供应，增加有机质、腐殖酸、氨基酸等有机营养，有利于作物糖分的积累，从而提高农产品的含糖量；
5、降低污染，保护环境，长期大量施用化肥、农药，使土壤受到不同程度的污染，产生一定的毒性。酵素肥具有降解和转化土壤中有毒物质的能力。
