由轨道舱、返回舱和推进舱组成。神舟载人飞船全长8、86米，最大处直径2、8米，总重量达到7790公斤。从构型上来说，由轨道舱，返回舱和推进舱以及一个附加段组成。采用的是典型的三舱一段式结构。整个飞船按照功能还能分为13个不同的分系统。这13个分系统都是用它的功能来命名的，它们是：有效载荷、结构与机构、热控制、指导导航与控制、推进、电源、数据管理、测控与通信、环境控制与生命保障、乘员、回收与着陆、仪表与照明和应急救生分系统。这些系统分别布置在三舱一段式结构的神州飞船中，相互分工合作，完成一次太空遨游。
