亲和层析是一种吸附层析， 抗原和相应的抗体发生特异性结合，而这种结合在一定的条件下又是可逆的。所以将抗原固相化后，就可以使存在液相中的相应抗体选择性地结合在固相载体上，借以与液相中的其他蛋白质分开，达到分离提纯的目的。
