坏掉的菠萝蜜会有一股怪臭味，味道会变酸，如果是熟透要烂的菠萝蜜果肉会散发出一种发酵的味道，而且果肉会发黑，如果已经完全变味，就不能再吃了。还有一种名为榴莲蜜的水果，又名尖蜜拉，果形、外皮及植株等特性均与菠萝蜜相似，较菠萝蜜小，皮较薄，因此又名小菠萝蜜，带有似榴莲般的气味。
菠萝蜜有干包和湿包之分，干包菠萝蜜的果肉呈现一粒粒的模样，比较容易分离出来，果肉的味道比较爽口、较嫩、清香、甘甜，人们多数更喜欢干包，另一种则为湿包，果肉软滑不容易分离出来，吃起来会有麦芽糖、蜂蜜甜味，会有浓郁之感，无论是干包还是湿包闻起来都有香甜之感。
