1、两者大小不同：苦杏仁是山杏仁的果实，颗粒呈心型，但是比较小，甜杏仁是仁用杏的果实，颗粒呈心形，形状比苦杏仁略大。
2、口味不同：甜杏仁吃起来可能是甜丝丝的，而苦杏仁有苦味儿，比西瓜子大一些。
3、两者药理作用不同：苦杏仁味苦，辛，性微温，有小毒，归肺经，大肠经，具有止咳平喘，润肠通便的作用，一般情况苦杏仁不做日常食用，而多作为药材。
苦杏仁：
苦杏仁，别名杏仁。拉丁文名：Semen Armeniacae Amarum.为蔷薇科植物山杏，夏季采收成熟果实，除去果肉及核壳，取出种子，晒干。主治功能有降气止咳平喘，润肠通便。用于咳嗽气喘，胸满痰多，血虚津枯，肠燥便秘。主产内蒙古、吉林、辽宁、河北、山西、陕西。杏仁分为甜杏仁及苦杏仁两种。我国南方产的杏仁属于甜杏仁（又名南杏仁），味道微甜、细腻，多用于食用，还可作为原料加入蛋糕、曲奇和菜肴中。
