1、小产权房无产权保障、不能办理过户手续。
根据建委发出购房风险提示指出，使用权、乡产权、小产权的房屋无产权保障，不具有房屋所有、转让、处分、收益等权利，且不能办理房屋产权过户手续。
2、小产权房无国家产权证书，不能抵押贷款、交易。
小产权房中的乡产房、村产房等并没有国家认可的产权证书，只有乡政府或村委会给的产权证，就不能像大产权的房子一样抵押给银行、也不能进行流转。
3、小产权房只能一次性付款，不能贷款，增加购房者的风险和压力。
购买乡产权那样的小产权房无法办理贷款，只能一次性或分期付款，这样无形中会加大购房人的资金压力，增加购房风险。
4、小产权房拆迁利益得不到保障。
小产权房拆迁时，将被视为违章建筑，得不到拆迁补偿。如果幸运有补偿，也是先将补偿款给产权拥有者，之后按先前购房协议补偿到每一位小产权房业主，如果没有协议，或者产权拥有者不讲诚信，小业主的利益得不到保障。
