艾灸烟有可能会把墙熏黑，若是用那些1：1的艾条，一定会薰黑房间，若是用10：1以上的艾条，就会薰黄房间。可以用排烟法或者滤烟法来处理艾灸烟。
在当时民间已有用艾叶烟熏治疗和预防疾病的习惯，而且这种习惯一直延续至今。古代民间认为艾叶燃烧产生的烟有防病，现代研究证明艾烟有防病、预防瘟疫的作用，因为艾烟对引起不同传染性、流行性疾病的多种致病菌、真菌和病毒都有抑制作用。
