青海湖的候鸟,其大多种类在印度和青藏高原南缘越冬,除了少量棕头鸥、渔鸥、斑头雁会在中国南方越冬,在夏季返回青海湖。根据1989年的调查,青海湖和沿湖周围有鸟类162种,其中繁殖鸟类最大的种群有:黑颈鹤、斑头雁、鸬鹚、赤麻鸭、鱼鸥、棕头鸥、天鹅、风头浅鸭、云雀等等。该地还是鸟类迁徙的的重要通道,每年春秋两季,大量的水禽都来此栖息和停歇。