米酒长黑毛是因为米酒在糖化过程中根霉菌繁殖过于旺盛造成的，也是霉菌的菌丝。在米酒发酵的过程中，主要有两个过程：糖化过程和酒化过程，这两个过程做工的主力分别是根霉菌和酵母菌。根霉菌可以将糯米中的淀粉分解成葡萄糖，完成整个糖化过程；酵母菌可以将生成的葡萄糖进而分解成酒精和水，完成整个酒化过程。这两者产生的比例要在合理的范围之内，否则就可能导致长黑毛、米酒变酸的情况。
