大葱主要病害有软腐病、紫斑病、葱锈病，应该注意田间湿度，以免积水过多到在烂根，在培土时要小心，以免对植株造成损伤，加强虫害的防治措施，在发病时没碰上可杀得和农用硫酸链霉素喷洒防治。
紫斑病主要危害叶片和花梗，发病时病变处出现水渍状的白色斑点，后逐渐变为淡褐色的圆形或纺锤形稍凹陷斑，还会继续扩大，病斑变为褐色或暗紫色。在温暖高温的夏季发病较严重，老庙和肥力不足的田块发病严重。合理轮作，增施有机肥和磷钾肥，提高植株抗病力，在发病初期可喷洒百菌清、杀毒矾和扑海因防治。
