冬季保温时，棚膜上加盖草苫，晴天打开，晚上盖严，靠太阳能提高棚温。为避免光线过强，可在棚膜下加遮阳网降低棚内的光照强度。有条件的地方可采取棚内煤火升温，但必须通过火墙或烟道将有害气体排出棚外。
在低温条件下，菌丝的呼吸量降低，所需的水分也随之减少，加之棚内封闭，水分难挥发，所以菇棚湿度需控制，加湿不宜过多。喷水一般以1至2天一次为宜。冬季宜用50℃左右的温水在棚内喷雾，保持棚内相对湿度在85%至95%。喷雾时不可将水集中到菇上，主要是因为若水分挥发不及时易引起黄斑病的发生。
