玻璃水是有毒的。现在市场有售的普通玻璃水均含有甲醛、甲醇、甘醇中的一种或多种有害成分。劣质的玻璃水多数是用水和酒精等兑而成，不仅损害汽车漆面光泽度，橡胶条的硬度，严重的还会引起橡胶件或其他塑料件产生色差、胀溶等。而玻璃水在清洗完玻璃后，会流到空调进风口附近，玻璃水挥发的气味也会沿着汽车空调的通风管道进入到驾驶室内。劣质的玻璃水挥发的气体是有害的，会成为危害车主健康的隐形杀手。
