1、培养方向不同。
军校的最高学府是国防大学，该校着重培养部队高级将领。从这里走出去的高级指挥官们，将是未来战争的引领与最高指挥者。
而士官院校教育，招收初中以上文化程度的优秀士兵，实施系统的职业培训，分别完成相应专业技术的技能训练，毕业后从事各种技术装备操作使用、维修保养和医疗护理工作。
2、收费标准不同。
上军校是免费的，国家会负担上学的花费！军校每年从部队和地方按比例招生，地方入校即入伍，享受军人待遇，在校期间一切学习生活费用由国家支付。代表院校有国防科技大学、解放军信息工程大学等，顺利毕业后工作由学校根据专业和各大军区需要分配，去向涉及海陆空三军。
但是士官学校部分是免费的，也有收费的，具体收费标准不同。
3、待遇不同
军校生是指根据军队建设需要，由军队院校从参加国家统一招生考试录取或保送入学且毕业后由军队统一分配的学生。它属于现役军人，发放的证件照片是穿军装，戴领花、肩章。持该证件可以享受现役军人待遇。而士官学校发放的证件不穿军装或无领花、肩章，该证件相当于学生证，不享受现役军人待遇
