目前还没有发现使用鸸鹋油存在任何副作用。尽管有缓解疼痛的作用，但一些专家不建议将其用于治疗腕管综合症或其他重复性压力损伤。原因是它可以掩盖住疼痛，以至于患者继续重复运动，使创伤无法正常修复并有可能导致永久性神经损害。
