自来也得知晓首领佩恩及成员小南的真正身份,原来是自己第二次忍界大战末期在雨忍村所收的徒弟。从前大蛤蟆仙人亦曾对自来也预言他会收一个独当一面的孩子为徒,而这孩子会为忍界未来带来空前的和平或毁灭,总会一天他就被迫要作出选择,他的选择会将世界引向和平或者毁灭。初时自来也以为眼前的佩恩,就是预言中的变革者,做出选择的时刻也已经到来了,故一场师徒之战一触即发。自来也一开始面对畜生道将其击败,后来又出现了两个佩恩,自来也使出仙人模式,召来两位蛤蟆仙人即深作及志麻大人相助,成功打败了佩恩三道,但之后天道出现,佩恩六道复活,因为不了解佩恩六道的相关情报,所以不幸被打败,但自来也本可以逃脱却仍然想查明真相,一人飞出水面去寻求真相被佩恩六道杀死。临死前自己查出了佩恩六道及其本体的秘密,并将情报由蛤蟆仙人带回木叶村。