要去掉。
因为芸豆中含有皂苷和血球凝集素，前者存于豆荚表皮，后者存于豆粒中。所以煮芸豆时一定要去皮而且煮透。芸豆的药用价值很高。我国古代医籍记载，味甘平，具有温中下气、利肠胃、止呃逆、益肾补元等功用，是一种滋补食疗佳品。芸豆还有镇静作用，对治疗虚寒呃逆、胃寒呕吐、跌打损伤、喘息咳嗽、腰痛、神经痛均有一定疗效。芸豆还是一种高钾低钠食品，很适合于心脏病、动脉硬化、高血脂和忌盐患者食用。现代医学分析，芸豆粒含有血球凝集素等多种球蛋白。
