1、国家级重点学科(3个):作物遗传育种、植物学、作物栽培学与耕作学(培育)。
2、农业部重点学科(2个):作物遗传育种、农产品加工及贮藏工程。
3、海南省重点学科(14个):化学工程与技术、作物学、水产养殖、材料物理与化学、生物化学与分子生物学、通信与信息系统、法学、马克思主义理论、农业经济管理、旅游管理、应用经济学(培育)、植物保护(培育)、园艺学(培育)、中国语言文学(培育)。