港澳通行证和G签并无区别，只存在先后关系。G签是在获得港澳通行证后，在港澳通行证上加上的签注。只有这样才能过境香港，G签表示的是个人自由行签注，持有G签可以自由来回香港。除此之外，还有其它一些签注（如L签），L签是团队旅游签注，必须有团队名单手续才能过关。另外还有一些探亲、商务等签注，这些是要有相关证明才能有的签注。
