发行股票的手续费应当从股票溢价中扣除，溢价不足抵扣的部分，冲减资本公积。手续费和佣金不计入成本。
与企业合并直接相关的费用包括：为进行合并而发生的会计，审计费用，法律服务费用，咨询费用。应计入合并成本。
如参与合并各方可能在企业合并合同或协议中规定，如果被购买方连续两年净利润超过一定水平，购买方需支付额外的对价，应并入合并成本。
