蜂蜜中含有少量的酵母菌，在适当浓度与适宜的温度条件下会引起蜂蜜发酵。
1、蜂蜜能吸收空气中的水分，浓度逐渐变稀，含水量超过21%时，有利于酵母菌的生长繁殖，就会将蜂蜜中的糖分分解成酒精和二氧化碳，这就是蜂蜜的发酵。
2、室温在10摄氏度以下时蜂蜜不易发酵，但在较高的温度下会加速蜂蜜的发酵，14-20摄氏度时蜂蜜最易发酵。
蜂蜜发酵后，表面会产生细小的泡沫，发酵初期能闻到一股淡淡的酸味，后来气泡越来越多，会造成蜜液膨胀，并溢出容器，能闻到强烈的酸味和酒味。
辨别蜂蜜是否发酵，可以观察蜂蜜的气泡，闻味道和品尝有无酸味、酒味，时间久了还会有陈腐味。
轻度发酵的蜂蜜，可以隔水加热到60度左右，保持半个小时，即可杀死酵母菌，中止发酵，然后去除上面的泡沫，密封保存，还是可以食用的。如果是发酵比较严重的蜂蜜，说明已经变质了，营养价值严重流失，只能扔掉，以免饮用后对身体健康产生不良影响。
