按照水泵的安装位置，还可以分为鱼缸泵、底缸泵。鱼缸泵安装在鱼缸内，它的作用是把鱼缸里的水输送到过滤池，大多数是三个一泵，也有不带造浪口的，但泵的进水口都有进水管和花篮，这种泵有吸便能力，吸水花篮可以阻挡大的脏物和鱼，尽量靠近缸底，主要用在上滤系统。底缸泵是安装在底缸内的，作用是把过滤后的水送回鱼缸。底缸泵没有吸水管和花篮，进水口有罩和海绵，一般底缸泵的扬程较高。
