马尼干戈,海拔4180米,属高山寒温带气候,冬长夏短。县城一带属高原河谷气候,寒冷干燥,澄彻晴朗,地势开阔,日照多,辐射强,年日照时数2640小时,有“小太阳城”之称,年平均气温5.6℃,最高气温31.7℃,最低气温极值-28.9℃,年平均降水量636.5毫米,含氧量相当于平原的67%。