如果加湿器本身不卫生，病菌就会随水蒸气漂浮在空气中，对人的健康造成危害。不能直接将自来水加入加湿器。因为自来水中含有多种矿物质，会对加湿器的蒸发器造成损害，所含的水碱也会影响其使用寿命。自来水中的氯原子和微生物有可能随水雾吹入空气中造成污染。如果自来水硬度较高，加湿器喷出的水雾中因含有钙镁离子，会产生白色粉末，污染室内空气。
